Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Npas1P97459 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Npas1P97459 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Npas1P97459 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Npas1P97459 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Npas1P97459 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Npas1P97459 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Npas1P97459 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Npas1P97459 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Npas1P97459 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Npas1P97459 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Npas1P97459 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Npas1P97459 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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