Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
H3f3aP84244 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
H3f3aP84244 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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