Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcaP82350 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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