Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SgcdP82347 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms