Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gabpb2P81069 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms