Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl39P62892 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms