Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp5P56399 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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