Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sh3bp1P55194 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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