Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Aqp4P55088 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Aqp4P55088 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms