Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rad23bP54728 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms