Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgd1P52734 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms