Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms