Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
FmodP50608 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FmodP50608 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms