Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LtbrP50284 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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