Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Hoxc13P50207 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Hoxc13P50207 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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