Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mmp9P41245 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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