Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtbP41155 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtbP41155 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LtbP41155 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LtbP41155 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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