Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tjp1P39447 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms