Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab20P35295 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rab20P35295 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms