Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

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Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn11P35235 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn11P35235 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn11P35235 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn11P35235 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn11P35235 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn11P35235 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn11P35235 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptpn11P35235 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn11P35235 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ptpn11P35235 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ptpn11P35235 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ptpn11P35235 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ptpn11P35235 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ptpn11P35235 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptpn11P35235 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms