Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.8 ms