Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NapbP28663 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NapbP28663 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms