Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms