Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms