Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxb9P20615 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxb9P20615 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb9P20615 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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