Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms