Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P20040 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P20040 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P20040 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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