Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PdgfaP20033 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PdgfaP20033 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PdgfaP20033 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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PdgfaP20033 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PdgfaP20033 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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PdgfaP20033 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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