Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18533 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18533 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms