Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PcnaP17918 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms