Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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DmdP11531 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DmdP11531 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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DmdP11531 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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DmdP11531 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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DmdP11531 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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DmdP11531 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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DmdP11531 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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DmdP11531 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms