Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P10404 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P10404 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P10404 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P10404 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P10404 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P10404 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P10404 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P10404 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P10404 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P10404 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P10404 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P10404 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P10404 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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