Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-K1P01901 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms