Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms