Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PomcP01193 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PomcP01193 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PomcP01193 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PomcP01193 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PomcP01193 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PomcP01193 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PomcP01193 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms