Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms