Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Prrt1O35449 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Prrt1O35449 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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