Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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Foxd2O35392 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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Foxd2O35392 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Foxd2O35392 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Foxd2O35392 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Foxd2O35392 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms