Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Kcns1O35173 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Kcns1O35173 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Kcns1O35173 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Kcns1O35173 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms