Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kif1cO35071 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms