Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Degs1O09005 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Degs1O09005 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Degs1O09005 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Degs1O09005 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Degs1O09005 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Degs1O09005 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Degs1O09005 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Degs1O09005 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Degs1O09005 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Degs1O09005 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Degs1O09005 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Degs1O09005 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Degs1O09005 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Degs1O09005 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Degs1O09005 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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