Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms