Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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