Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp35M0QWN7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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