Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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