Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms