Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Fndc9-201ENSMUST00000060185 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm20517G3UVU6 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms