Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms