Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Eef1d-218ENSMUST00000154584 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Vegfd-201ENSMUST00000033751 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Pcdhb5-201ENSMUST00000078271 3535 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 4933431E20Rik-210ENSMUST00000152663 2358 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Mrps5-201ENSMUST00000028852 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm7435-202ENSMUST00000216003 2424 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Pkd2l2-202ENSMUST00000166156 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Pilrb1-206ENSMUST00000199387 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Clca2-201ENSMUST00000040465 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Nod2-201ENSMUST00000054324 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Palmd-201ENSMUST00000040097 2433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Glul-201ENSMUST00000086199 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Grk2-201ENSMUST00000025791 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Ttc39b-203ENSMUST00000102823 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Slc16a4-202ENSMUST00000106723 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Cnga3-204ENSMUST00000195272 2197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Hk1-201ENSMUST00000072357 3639 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Cd22-210ENSMUST00000189718 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Parva-203ENSMUST00000106643 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Ttll1-203ENSMUST00000109480 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Cyp2b9-201ENSMUST00000082214 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gm45873-201ENSMUST00000211865 1915 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Gm20538F6Z9R1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms