Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms